มหาวิทยาลัย มีแผนแม่บทโครงการอนุรักษ์พันธุกรรมพืชฯ ที่มีแผนการดำเนินการสำรวจสถานภาพของพื้นที่ลุ่มน้ำต่าง ๆ ในจังหวัดจันทบุรีและตราด เพื่อศึกษาสถานภาพความหลากหลายทางชีวภาพ การลดมลพิษทางน้ำ อนุรักษ์และฟื้นฟูแหล่งที่อยู่อาศัย ปรับตัวต่อการเปลี่ยนแปลงสภาพภูมิอากาศ และการ สร้างเข้าใจ และตระหนักถึงความสำคัญของระบบนิเวศทางน้ำ และส่งเสริมการมีส่วนร่วมในการอนุรักษ์ โดยทำงานร่วมมือกับภาคส่วนต่าง ๆ ทั้งภาครัฐและเอกชน ในการร่วมมือกันดำเนินโครงการ