มหาวิทยาลัยราชภัฏรำไพพรรณีดำเนินงานร่วมกับภาคเอกชนและหน่วยงานที่เกี่ยวข้องเช่นทัพเรือภาคที่ 1 กองเรือยุทธการ ในการนำเทคโนโลยีและแนวทางปฏิบัติมาใช้ป้องกันความเสียหายต่อระบบนิเวศทางน้ำและชายฝั่ง โดยโครงการพัฒนาเครือข่ายฟื้นฟูปะการังและสร้างแหล่งเรียนรู้ร่วมกับบริษัทเอจีซี วีนิไทย ได้ติดตั้งทุ่นไข่ปลาและทุ่นผูกเรือเพื่อลดผลกระทบจากกิจกรรมทางทะเลต่อแนวปะการัง ในพื้นที่แนวปะการังในภาคตะวันออก พร้อมทั้งประยุกต์ใช้เทคโนโลยีดักจับขยะทะเลบริเวณเกาะจิก จังหวัดจันทบุรี นอกจากนี้ มหาวิทยาลัยยังสนับสนุนงานวิจัยเรื่องการประเมินการชะล้างพังทลายของดินในลุ่มน้ำจังหวัดจันทบุรี โดยใช้สมการ USLE ร่วมกับระบบสารสนเทศภูมิศาสตร์ เพื่อเป็นข้อมูลประกอบการจัดการพื้นที่และลดผลกระทบต่อระบบนิเวศ อีกทั้งมหาวิทยาลัยกับบริษัท ปตท.สำรวจและผลิตปิโตรเลียม จำกัด (มหาชน) ร่วมกันดำเนินโครงการ Ocean for Life ผ่านกิจกรรมปลูกป่าชายเลนในชุมชนเขาสำเภาคว่ำ เพื่อช่วยลดการกัดเซาะชายฝั่งและฟื้นฟูระบบนิเวศ และโครงการ “พัฒนาระบบเพาะฟักสัตว์น้ำเศรษฐกิจและสื่อการเรียนรู้ ณ กลุ่มพังสาย จังหวัดสงขลา” เพื่อส่งเสริมการใช้เทคโนโลยีและแนวทางที่เหมาะสมในการอนุรักษ์ทรัพยากรทางน้ำอย่างยั่งยืน รวมทั้งดำเนินงานตรวจสอบคุณภาพแหล่งน้ำผ่านงานวิจัยเรื่อง “Relationship of eutrophication, phytoplankton and water quality: some generalities in Chanthaburi River, Thailand”